Narodowe Centrum Nauki

Celem nadrzędnym niniejszego badania jest przeprowadzenie analiz w zakresie wpływu składu mleka kobiecego na jakość snu niemowląt. Do badania włączone zostanie 50 kobiet w drugim miesiącu laktacji (8-11 tydzień), karmiących wyłącznie piersią. Dodatkowe kryteria włączenia do badania obejmują: poród w terminie (od 38. tygodnia), brak chorób przewlekłych, negowanie nikotynizmu (aktywnego i biernego), brak problemów laktacyjnych, uniemożliwiających pobranie próbki mleka w 4. punktach czasowych w ciągu doby (całkowita objętość 20 ml), wyrażenie pisemnej zgody na udział w badaniu. W próbkach mleka oznaczony zostanie profil aminokwasów egzogennych oraz monoamin (m.in. melatoniny i serotoniny), wartość energetyczna i zawartość makroskładników odżywczych (białka, tłuszczu i laktozy). Dodatkowo, ze względu na fakt, że w mleku kobiecym znajdują się również składniki o działaniu poza odżywczym, m.in. hormony, analizie poddane zostanie stężenie leptyny i greliny – hormonów regulujących apetyt/głód.

Jakość snu niemowląt zostanie oceniona przy użyciu zwalidowanego kwestionariusza BISQ-E (ang. Extended Brief Infant Sleep Questionnaire). Oprócz
danych socjo-demograficznych, okołoporodowych i antropometrycznych, kobiety biorące udział w badaniu zostaną poproszone o wypełnienie kwestionariuszy żywieniowych – dzienniczka 3-dniowego bieżącego notowania oraz kwestionariusza częstości spożycia wybranych grup produktów
spożywczych, a także kwestionariusza PSQI (dotyczącego jakości ich snu). Pozwoli to na przeprowadzenie analiz dotyczących wpływu czynników pochodzenia matczynego i środowiskowego na zawartość wybranych składników mleka kobiecego.

The aim of the study
Heterotopic ossification (HO) is a dysregulation of skeletal muscle homeostasis and regeneration that leads to the
formation of mature bone in untypical locations. The direct molecular mechanism leading to the formation of HO
has not yet been described. Importantly, HO formation is related to the state of hypoxia and inflammation, and is
likely related to disturbances in BMP (bone morphogenic protein) and TGFβ (transforming growth factor β) signaling
pathways. However, other factors, such as TLR (toll-like receptor), that play a key role in inducing an innate immune
response, could be involved. Importantly, the knowledge about the role of ncRNA (non-coding RNA), such as miRNA
(microRNA) and lncRNA (long non-coding RNA), in the formation of HO is limited. The miRNA and lncRNA are
molecules that affect the expression of target mRNAs. Thus, identification of miRNA and lncRNA is important for
understanding the mechanism of HO formation. Our preliminary data (high-throughput sequencing) showed
changes in mRNA and lncRNA expression in muscles of patients suffering from HO after hip arthroplasty compared
to healthy donors. On the basis of bioinformatic analysis, we selected miRNA and lncRNA molecules that could play
a role in the HO formation. We hypothesized that the formation of HO is related to disturbances in the expression
of miRNAs or lncRNAs. We believe that these molecules may affect the expression of BMPs, TGFβ, TLR or other
proteins involved in signaling that impairs myogenesis and induces osteogenesis. Thus, the aim of this project is
to verify the role of selected molecules in the HO formation. To do so, human mesenchymal stromal cells or human
myoblasts will be transfected with selected miRNA and lncRNA molecules and an analysis of their differentiation
into chondroblasts or osteoblasts, cultured under hypoxic, normoxic or inflammatory conditions in vitro, will be
performed. Furthermore, the transfected human cells will be transplanted into SCID mice muscles or
subcutaneously, what will allow functional in vivo verification of the obtained data. The new information on the
molecules involved in the formation of HO will allow us to validate their role in HO and follow their level in patients.
Thus, the level of selected miRNAs, lncRNAs, and mRNA of proteins involved in osteogenesis (such as BMPs, TGFβ,
TLR) will be analyzed in the tissue samples of healthy donors, patients who underwent hip arthroplasty, and patients
suffering from HO. Identifying miRNAs and lncRNAs would be of great importance to understand the mechanism of
HO formation. In addition, the identification of such molecules would be crucial to evaluate them as predictors of
HO formation. Such molecules could be used as markers to monitor the ossification formation and possibly
implement the appropriate treatment. Furthermore, these molecules could become a potential targets for therapy.

Ponieważ entoza jest procesem wciąż nie do końca zdefiniowanym, a wiedza dotycząca mechanizmów i czynników molekularnych zaangażowane w promowanie internalizacji komórek jest słaba, naszym celem jest identyfikacja i walidacja nowych genów, białek i biologicznych szlaki związane z rozwojem struktur entotycznych.  Pierwszym konkretnym celem jest wyjaśnienie roli ekspresji i aktywacji ERM i merlina w procesie tworzenia struktur entotycznych. Naszym drugim konkretnym celem jest identyfikacja nowych genów i szlaków sygnałowych wpływających na tworzenie figur entotycznych in vitro, przy użyciu analizy seq RNA opartej na sekwencjonowaniu nowej generacji (NGS). Wstępne dane. W naszych badaniach pilotażowych ocenialiśmy częstość występowania entozy w tkance pierwotnego i przerzutowego raka piersi. W badaniu wykazano, że całkowita liczba entoz w guzie przerzutowym jest istotnie większa w porównaniu z guzem przerzutowym guz pierwotny. W badaniu in vitro na komórkachpochodzących z raka piersi i trzustki podkreśliliśmy rolę PDPN (podoplanina) w rozwoju komórek entotycznych. Odkryliśmy, że PDPN działa jako inhibitor entozy. Co ważne, my zaobserwowaliśmy, że wyczerpanie PDPN aktywuje wybrane białka z rodziny FERM (ERM - ezrin/radixin/moesin i merlin). Zakładamy zatem, że profil ekspresji genów w komórkach entotycznych różni się od ekspresji genów komórek nieentotycznych komórki i niektóre dotknięte geny w komórkach entotycznych mogą mieć kluczowe znaczenie dla tworzenia struktur CIC. Zwłaszcza, że ​​jesteśmy zainteresowany badaniem związku między poziomem wewnątrzkomórkowym a stanem aktywacji białek będących przedmiotem zainteresowania, oraz częstotliwość powstawania struktur entotycznych. Ponadto oczekuje się selekcji komórek entotycznych za pomocą cytometrii przepływowej i analizy ich profilu ekspresji (sekwencja RNA) aby odkryć nowe regulatory entozy. Według naszej wiedzy, takiego badania nie przeprowadzono wcześniej. Oczekujemy, że wyniki odkryją nowe molekularne sterowniki entozy.

Celem projektu jest zatem taka manipulacja genami odpowiadającymi za pobór i akumulacje zanieczyszczeń u cukinii, aby, w zależności od potrzeb, zwiększyć zdolność tych roślin do usuwania zanieczyszczeń (fitoremediacja) lub produkować warzywa wolne od pozostałości leków (produkcja bezpiecznej żywności). Wymaga to użycia określonych regulatorów, które kontrolują zdolność roślin z rodziny dyniowatych do poboru i akumulacji szeregu zanieczyszczeń. Zespół badawczy wyodrębnił kilka substancji, dwie z ich charakteryzują się unikalnymi właściwościami pozwalającymi na podniesienie tempa usuwania zanieczyszczeń organicznych z gleby, a dwie kolejne pomagają obniżyć ich akumulację w tkankach roślin. Substancje te to substancje aktywne komercyjnie dostępnych środków grzybobójczych.

Celem proponowanego badania jest ocena integralności nabłonka jelitowego, przecieku LPS, białek tkanki tłuszczowej i profilu lipidowego u modelowych szczurów traktowanych dietą wysokotłuszczową i wyciągami z owoców rokitnika zwyczajnego, pigwowca japońskiego i derenia jadalnego. W tkance jelitowej szczurów zostanie określona ekspresja białek kluczowych dla integralności nabłonka jelitowego oraz wychwytu glukozy i lipidów. Określone zostaną zmiany populacji bakterii oraz bakteriofagów po zastosowaniu ekstraktów. Szczególnym celem tego badania będzie ocena potencjalnego hamowania enzymów bakteryjnych z klasy nukleaz przez ekstrakty lub ich główne składniki. Określenie roli produktów pochodzenia roślinnego w kształtowaniu mikroflory jelitowej poprzez wpływ na wirusy i nukleazy bakteryjne będzie stanowić nowy kierunek badań w odniesieniu do interakcji dieta-mikrobiom oraz mechanizmu zasiedlania niszy jelitowej.

Celem projektu jest ocena wpływu pyłów zanieczyszczenia powietrza i mikroplastiku na procesy biologiczne związane z uszkodzeniem nabłonka oddechowego w modelu in vitro ostrego i przewlekłego uszkodzenia płuc.

Cel ten będzie realizowany przy użyciu modelu 3D in vitro ostrego i przewlekłego uszkodzenia nabłonka zawierającego współhodowle makrofagów i komórek nabłonka oskrzeli. Modele te będą fizycznie ranione, a właściwości regeneracyjne komórek będą oceniane w hodowlach po ekspozycji na pył zawieszony z zanieczyszczenia powietrza i włókna mikroplastiku.