Diagnostyka glejaków na podstawie wolnokrążącego DNA guza.

Glejaki są w zasadzie nieuleczalne pomimo znacznego postępu w chirurgii, radioterapii i chemioterapii. Właściwe rozpoznanie typu glejaka, wczesne rozpoznanie progresji molekularnej, scharakteryzowanie krytycznych mutacji lub cech epigenetycznych daje nadzieję na poprawę wyników leczenia. Planowane jest opracowanie kompleksowego testu opartego na analizie materiału pobranego z guza (ukierunkowane sekwencjonowanie NGS 700 genów) oraz próbę opracowania “liquid biopsy” opartej o analizę wolnokrążącego DNA (cfDNA) guza we krwi, co mogło by stanowić małoinwazyjną opcję dla biopsji. Dodatkowymi celami są: kompleksowa charakterystyka genomu i transkryptomu guza oraz zastosowanie hodowli 3-D glejaka in vitro, m.in. w środowisku hipoksji, do oceny komórek macierzystych i podatności komórek na terapie w środowisku niszy nowotworowej. Realizacja zadań przyczyni się do lepszej znajomości biologii glejaków, pozwoli na identyfikację nowych biomarkerów molekularnych, celów terapeutycznych, a także będzie stanowiła praktyczny model do badania odpowiedzi na leczenie w hipoksji. Opracowanie testu diagnostycznego pozwoli na poprawę skuteczności leczenia poprzez jego dopasowanie do molekularnego podtypu guza a liquid biopsy poprawiłaby dostępność do diagnostyki, komfort i bezpieczeństwo pacjentów i oznaczałoby zupełnie nowe możliwości monitorowania przebiegu choroby, niedostępne do tej pory.
Projekt realizowany przez Konsorcjum
- Śląski Uniwersytet Medyczny w Katowicach
- Instytut Biologii Doświadczalnej im. M. Nenckiego Polskiej Akademii Nauk
- Warszawski Uniwersytet Medyczny
- Akademickie Centrum Komputerowe Cyfronet Akademii Górniczo-Hutniczej im. St.Staszica w
Krakowie
- Oncogene Diagnostics
- Regionalne Centrum Naukowo-Technologiczne