Charakterystyka meticylino-opornych Staphylococcus aureus, zawierających gen ermB, przy zastosowaniu technologii sekwencjonowania nowej generacji (WGS-NGS)

Symbol
1M20/NCN7
Rok początku realizacji
2020
Acronym
PROJEKT_MINIATURA 3
Project Title
Charakterystyka meticylino-opornych Staphylococcus aureus, zawierających gen ermB, przy zastosowaniu technologii sekwencjonowania nowej generacji (WGS-NGS)
Nazwa Kliniki/Zakładu
Katedra i Zakład Mikrobiologii Lekarskiej
Konkurs/program
MINIATURA 3
Code
1M20
Financing Institution
Lead
dr Ksenia Ewa Szymanek-Majchrzak
Numer umowy o dofinansowanie
DEC- 2019/03/X/NZ6/02096/2
Total awarded funds MUW ONLY
49 764,00
Total awarded funds FOR ALL
49 764,00
Subject
Charakterystyka meticylino-opornych Staphylococcus aureus, zawierających gen ermB, przy zastosowaniu technologii sekwencjonowania nowej generacji (WGS-NGS)
Project Objective
Expected results
Uzyskane wyniki dostarczą cennych informacji o charakterze poznawczym na temat nowych wariantów MRSA, które w ostatnich latach pojawiły się w Polsce, a zwłaszcza na temat obecności genów determinujących oporność na antybiotyki oraz genów kodujących czynniki zjadliwości. Analiza genomu pozwoli również na: identyfikację oraz charakterystykę elementów genetycznych na których przenoszony jest gen ermB; ocenę zagrożenia epidemiologicznego wariantami VRSA; ocenę pochodzenia oraz pokrewieństwa wyselekcjonowanych izolatów; jak również, co bardzo istotne weryfikację przydatności
metody WGS-NGS do szczegółowych analiz genomu S. aureus oraz ustalenia minimalnego zakresu NGS, niezbędnego do uzyskania oczekiwanych rezultatów.